Ettersom antikkens bosetninger på Samos lå i deler av det som i dag er Pythagorion kommune er det her du finner fornminner og utgravningsområder. De fleste utgravningsområdene finner du i byen Pythagorion og i området som strekker seg til Ireon.

I Pythagorion finner du både folkemuseum og arkeologisk museum. Ønsker du å besøke andre museer må du til Samos by eller Mitilinii. I Samos by er det blant annet et større arkeologisk museum, mens det i Mitilinii er et Paleontologisk museum.

Andre severdigheter i Pythagorion er Logothetisborgen, Metamorphosekirken og klosteret Spilliani. Eupalinostunnelen er et "monument" for seg selv og i noen vitenskapelige kretser betegnet som verdens åttende underverk